Dr Mario Bueno Bioinformatica
Biocomputación - Bioinformática - Biomecatrónica - Procesamiento de Imágenes            English_USA
Unidad de Bioinformática y Biocomputación  
Dr. Mario A. Bueno
Profesor Investigador


Unidad multidisciplinaria que provee conocimiento, infraestructura y solución de problemas en el análisis de información biológica, utilizando teoremas y procedimientos en el estado del arte; además es un acelerador para la emisión de resultados provenientes de las diferentes áreas que integran esta unidad biotecnológica (BIOTECSIN).
Se aplican una variedad de sistemas y diseñan algoritmos que resuelvan un sinnúmero de problemas en el análisis de información, cubriendo un amplio espectro de necesidades provenientes de las ciencias biológicas. Además recomienda la infraestructura computacional y de comunicaciones para llevar a cabo la tarea de análisis de información biológica, tomando en cuenta las necesidades futuras de crecimiento de la unidad de biotecnología y proveer una base sólida de software para cubrir las posibles necesidades derivadas de proyectos aprobados, dando un soporte integral a los diferentes laboratorios y sus titulares.
En la formación de Recursos Humanos esta unidad tiene una estructura diseñada para que alumnos de licenciatura y posgrado se beneficien por medio de la aplicación de sistemas clásicos en el análisis de información, así como el aprendizaje de estos algoritmos que son enseñados desde un punto de vista matemático y computacional, de esta forma alumnos de las carreras de ingeniería biomédica, biología, ciencias computacionales y carreras afines son candidatos ideales para explotar este tipo de conocimientos.

DISEÑO DE TECNOLOGÍAS DE INFORMACIÓN AUTOMATIZADAS PARA EL ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO DE BANCOS DE GERMOPLASMAS

Fusarium      El uso de agroquímicos ha permitido obtener incrementos substanciales en la producción; no obstante, sus efectos adversos impactan significativamente la sostenibilidad de la agricultura. En los últimos años, sin embargo, se ha buscado el establecimiento de alternativas biológicas de manejo de plagas y enfermedades. Una etapa muy importante en este proceso es el desarrollo de metodologías que nos permitan la identificación de una manera rápida y segura de agentes de biocontrol. Por lo que se desarrolló y aplicó una tecnología biocomputacional automática... (leer más)

ALGORITMOS BIOCOMPUTACIONALES PARA EL ANÁLISIS DE MICRO Y MACROARREGLOS

Microarreglos      El desarrollo del proyecto del genoma humano ha facilitado que haya una masiva generación de nuevas tecnologías relacionadas con la ejecución de experimentos y análisis a un gran número de genes en paralelo, ejemplos son los llamados microarreglos de DNA o “chips” de DNA.
Estas técnicas tienen la capacidad de realizar mediciones de niveles de mRNA a células en particular o a un gran número de genes de tejidos. Así, con el objetivo de analizar miles de genes de interés, se colocan cadenas de DNA, por ejemplo una biopsia de algún tumor cancerígeno en puntos específicos (“spots”) dentro de una cuadrícula (“arreglo”) sobre una ... (leer más)

 

 

ALGORITMOS ÓPTICO-COMPUTACIONALES Y MICROSCOPÍA

Microscopia      Dentro de los trabajos de investigación y cómo titular de la unidad de bioinformática y biocomputación del CIIDIR-Sin he propuesto un nuevo algoritmo para determinar la fusión de múltiples imágenes de varios campos policromáticos capturados en la región de mejor enfoque a partir de una muestra biológica. Esta región de enfoque es construida mediante la inclusión de varios campos encontrados arriba y abajo de la posición Z donde se encuentra la mejor imagen, es decir ... (leer más)

PROCESAMIENTO DE IMÁGENES E IDENTIFICACIÓN DE PARTÍCULAS BIOGÉNICAS

      En el año 2005, Bueno-Ibarra et al. propusieron y desarrollaron una plataforma biocomputacional que solucionaba la problemática de adquisición, procesamiento e identificación de partículas biogénicas por medio de técnicas óptico-matemáticas y computacionales, actualmente se extienden estas técnicas para desarrollar sistemas automáticos de procesamiento en el área de biología molecular y de bioinformática para soportar multidisciplinariamente las actividades de investigación que ayudan a los productores del Estado de Sinaloa a obtener alimentos libres de patógenos.
La tecnología computacional desarrollada se centra en la...(leer más)

 

 

Biomecatrónica

      La Biomecatrónica es un área emergente de conocimiento aplicado, donde se conjuntan varios ámbitos de conocimiento colaborando multidisciplinariamente tales como la robótica, mecánica, electrónica, sensores y la computación. Los objetivos son de investigar y desarrollar soluciones a problemas reales de las necesidades tecnológicas que son necesarias en el desarrollo social y la economía nacional, adicionalmente el segundo objetivo es la formación de recursos humanos de alto nivel como investigadores y tecnólogos.

MicrocontroladorEn el módulo de bioinformática y biocomputación se proponen trabajos en el ámbito de la Biomecatrónica con aplicaciones en el análisis de secuencias genéticas a partir de microcontroladores embebidos, adicionalmente se desarrollan líneas de investigación por medio de la utilización de micro robots en el análisis de suelos, cultivos y monitoreo en invernaderos.

Personalmente es de especial interés aplicar estos conceptos en la formulación de proyectos que conlleven al análisis automatizado de regiones cultivadas por diversas plantas que presenten un interés social y alimenticio en el Estado de Sinaloa; adicionalmente la aplicación de agentes inteligentes para el monitoreo de plagas, humedad, temperatura, nutrientes, etc. son problemáticas típicas que se presentan.
 

 


 

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Análisis de secuencias genéticas
Desarrollo de sistemas computacionales para el análisis
de secuencias genéticas


 

Reconocimiento de partículas biológicas
Reconocimiento automático
de partículas biogénicas


 

Microscopía
Adquisición de imágenes por
medio de la automatización de dispositivos de microscopía.


 

Visión
Procesamiento de imágenes y algoritmos en visión por
computadora


 

Seminarios
Cursos, Seminarios y
Conferencias.


 
   
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